OTS - A Swift Biosciences új, ágazatvezető indexált adaptereket bocsát ki, amelyekkel nagyobb számú minta szekvenálható egyetlen futtatásban (1. rész)
2017. August 07. 11:25
Ann Arbor, Michigan, USA, 2017. augusztus 7., hétfő (Business
Wire/OTS) - A forradalmian új technológia felgyorsítja a
genomtérképezést, lehetővé teszi új biomarkerek felfedezését és
elősegíti a molekuláris tumorprofil-vizsgálatokat, valamint
folyadékbiopsziából származó minták elemzését
A genomszekvenálási célú, innovatív könytár-előkészítési
megoldások piacának egyik vezető cége, a Swift Biosciences ma
bejelentette egy új indexportfólió, az Accel-NGS® 2S Indexed
Adapters megjelentetését, amely jelentős mértékben javítja az
Illumina® platformokon végzett, újgenerációs multiplex szekvenálás
hatékonyságát. Ez az egyedi indexsorozat a kereskedelmi forgalomban
jelenleg hozzáférhető, nagy áteresztőképességű genomszekvánálási
célú alkalmazásokhoz használható legnagyobb indexportfólió, amely
lehetővé teszi a felhasználók számára, hogy megbízhatóan
felsokszorozzanak akár 96 egyetlen indexszel és 768 kettős
indexszel rendelkező mintát egy futtatásban. Ez az ágazatvezető
technológia képes kielégíteni a kutató és klinikai laboratóriumok
részéről jelentkező növekvő igényt az egy készülékfuttatásban
feldolgozható mintaszám növelése iránt, lehetővé téve a
gazdaságosabb szekvenálást, és ugyanakkor pontosabb adatokat
biztosítva.
A multiplex DNS-szekvenálás általánosan alkalmazott
munkamódszer, amely során több minta kerül jelölésre és egyazon
futtatásban való feldolgozásra az átmenőteljesítmény növelése és az
egy mintára eső szekvenálási költségek csökkentése érdekében. A
közelmúltban megjelent lektorált publikációk rámutattak, hogy a
kereskedelmi forgalomban kapható egyéb indexek használata során
gyakran előfordul az ún. "index hopping" [indexugrás] néven ismert
multiplexelési hiba (a szekvencialeolvasás hibás [nem a megfelelő
mintához való] hozzárendelése). Ugyanakkor a korábbi multiplex
DNS-szekvenálási technológiák használatakor egyéb szekvenálási
hibák is gyakrabban fordulnak elő, melynek következtében tovább nő
a hibás hozzárendelések száma. A nagyobb kapacitású szekvenálási
platformok (mint például az Illumina legújabb, NovaSeq™ nevű
platformja) megjelenésével fokozottabban jelentkezik az igény az
olyan megbízható indexek iránt, amelyek segítségével nagy számú
minta párhuzamos multiplexelése végezhető el nagy pontossággal.
A Swift Biosciences kutatói által adott tájékoztatás szerint a
cég Accel-NGS 2S Indexed Adapters terméke egy 96 indexet tartalmazó
készlet, melyet az Illumina TruSeq® P5 adapterekkel való
használatra optimalizáltak, így a két termék együttes
alkalmazásával akár 768 egyedi, kétszeresen indexált kombináció is
létrehozható. Az új indexek nagyobb rugalmasságot biztosítanak egy
futtatásban 96-768 egyedileg indexált minta feldolgozásához, és így
többféle, eltérő szekvánálási mélységű projekt végrehajtására is
alkalmasak. Ezen felül a termék különleges kialakítása kiküszöböli
az Illumina áramlási celláira jellemző hozzárendelési és
indexugrási hibákat is. Ezeknek a fejlesztéseknek köszönhetően
nagyobb érzékenységgel kimutathatók a ritkán előforduló variánsok
is, és megbízhatóbbá és gyorsabbá válik az adatelemzés során
végzett demultiplexálás.
"A Swift célja az, hogy lehetővé tegyük a tudósok számára olyan
magas minőségű adatok kinyerését bármilyen mintatípus esetén,
amelyek akár új tudományos felfedezések alapjául is szolgálhatnak"
- fejtette ki Timothy Harkins, a Swift Biosciences
elnök-vezérigazgatója. "Új Accel-NGS 2S indexált adaptereink
kiküszöbölik az Illumina platformokkal kapcsolatban az
áteresztőképesség és a költséghatékonyság terén mutatkozó
hiányosságokat, és az Accel-NGS 2S technológiákkal kombinálva
minden szekvenálással foglalkozó laboratórium számára jobb minőségű
adatok kinyerését biztosítják jelentősen alacsonyabb költségek
mellett."(folyt.)
E közlemény hivatalos, mérvadó változata az eredeti
forrásnyelven közzétett szöveg. A fordítás csak az olvasó kényelmét
szolgálja, és összevetendő a forrásnyelven írt szöveggel, amely az
egyetlen jogi érvénnyel bíró változat.
-------------------------------------------------------------------
Az OTS internetes oldalán található hírek, közlemények, fotók a
forrásmegjelöléssel (OTS) szabadon és korlátozás nélkül
felhasználhatók. Továbbközlés esetén a közzétevő köteles az átvett
anyagot tartalmának torzítása nélkül, félreérthetőséget,
rosszindulatú következtetéseket kizáró, az eredeti
szövegkörnyezetnek megfelelő módon feldolgozni és megjelentetni.
Az OTS hírek nem képezik az MTI hírkiadás részét, az MTI által
szó szerint továbbított tartalomért minden esetben a beadó a
felelős.
© Copyright MTI Zrt.
Az OTS szolgáltatással kapcsolatban további információt a
(06-1) 441-9050 telefonszámon vagy a ots@mti.hu elektronikus
levelező címen kaphat.